8 de febrero de 1565 en Guatemala tras una larga enfermedad. Allí se libró una batalla definitiva para la conquista de Yucatán, que ganaron los europeos. Una vez consumada la conquista, «el Adelantado» se encargó de la gubernatura de Yucatán a partir de 1546, pero por quejas recibidas en la corte española fue destituido de su cargo en 1550, regresando a la metrópoli para asumir su propia defensa ante el Consejo de Indias.
